화난 해산물 시장의 유전자 추적으로 COVID 동물 기원이 더욱 뒷받침됨

새로운 국제 협력 연구에서는 2019년 말에 COVID-19 팬데믹을 일으킨 바이러스인 SARS-CoV-2가 발생한 시장에 존재하는 야생 동물 종 목록을 제공합니다. 이 연구는 중국 질병통제예방센터(CDC)에서 발표한 메타전사체 데이터에 대한 새로운 분석을 기반으로 합니다. 이 데이터는 2020년 1월 1일부터 화난 해산물 도매 시장에서 수집한 800개 이상의 샘플과 초기 COVID-19 환자에게서 보고된 바이러스 유전체에서 나왔습니다. 이 연구는 9월 19일 저널 Cell 에 게재되었습니다.

"이것은 COVID-19 팬데믹의 기원에 대한 가장 중요한 데이터 세트 중 하나입니다." 프랑스 국립 과학 연구 센터(CNRS)의 공동 저자인 플로랑스 드바르가 말했습니다. "우리는 데이터가 존재하고 공유되어 매우 감사합니다."

"이 논문은 모든 것이 동일한 시나리오를 지적하는 축적된 증거에 또 다른 층을 추가합니다. 즉, 감염된 동물이 2019년 11월 중순에서 하순에 시장에 유입되었고, 이것이 팬데믹을 촉발했습니다." 공동 책임 저자인 스크립스 연구소의 크리스티안 앤더슨이 말했습니다.

"우리는 중국 CDC 팀이 수집한 매우 중요한 데이터를 새롭고 엄격한 방식으로 분석했습니다." 애리조나 대학교의 공동 책임 저자인 마이클 워로비가 말했습니다. "이것은 그 데이터에 대한 권위 있는 분석이며, 그것이 팬데믹이 시작된 방식에 대한 우리가 가진 방대한 증거의 나머지와 어떻게 들어맞는지에 대한 것입니다."

2020년 1월 1일, 동물들이 옮겨지고 시장이 문을 닫은 지 몇 시간 후, 중국 CDC 조사관들이 시장으로 가서 샘플을 수집했습니다. 그들은 노점의 바닥, 벽 및 기타 표면을 면봉으로 닦았고, 며칠 후 돌아와서 야생 동물을 판매하는 노점의 표면, 예를 들어 동물을 옮기는 데 사용되는 우리와 카트에 집중한 다음 배수구와 하수도에서 샘플을 수집했습니다.

그들은 샘플의 메타전사체 시퀀싱을 수행했는데, 이는 샘플에 존재하는 모든 유기체(바이러스, 박테리아, 식물, 동물, 인간)의 모든 RNA 시퀀스(그리고 DNA도 수집할 수 있음)를 얻는 것을 목표로 하는 기술입니다. 류 준이 이끄는 중국 CDC 팀은 2023년에 저널 네이처 에 데이터와 결과를 발표했습니다 . 그러나 이 기사는 데이터에서 발견된 동물 종의 정확한 신원을 밝혀내지 못했으며, 이는 그럴듯한 중간 숙주를 나타낼 수 있습니다. 중국 CDC는 공개 및 오픈 리포지토리에서 시퀀싱 데이터를 공유했습니다.

Cell 에 게재된 이 데이터의 최신 분석에 따르면 , SARS-CoV-2는 시장에서 판매되는 야생 동물과 동일한 노점 중 일부에 존재했습니다. 여기에는 너구리 개(너구리와 유사한 표시가 있는 작은 여우와 같은 동물)와 사향 고양이(몽구스와 하이에나와 관련된 작은 육식 포유류)가 포함됩니다. 어떤 경우에는 SARS-CoV-2 바이러스와 이 동물의 유전 물질이 동일한 면봉에서 발견되기도 했습니다. 정확한 동물 종은 샘플에서 미토콘드리아 유전체를 유전자형 분석하여 식별했습니다.

"중국 CDC 팀이 도착하기 전에 주요 동물 종 대부분이 제거되었기 때문에 동물들이 감염되었다는 직접적인 증거를 얻을 수 없습니다."라고 Débarre는 말합니다. "우리는 환경 샘플에서 이 동물들의 DNA와 RNA 유령을 보고 있으며, 일부는 SARS-CoV-2가 발견된 마구간에서도 발견되었습니다. 이것은 시장에 감염된 동물이 있는 시나리오에서 예상할 수 있는 일입니다."

"이것들은 우리가 2002년에 인간에게 SARS 코로나바이러스가 전파되는 것을 도운 것과 같은 종류의 동물입니다." 워로비는 덧붙여 말한다. "이것은 우리가 할 수 있는 가장 위험한 일입니다. 바이러스가 가득한 야생 동물을 데려다가 대도시 중심부에 사는 인간과 접촉시켜 불장난을 하는 것입니다. 인구 밀도가 높아 바이러스가 퍼지기 쉽습니다."

국제팀은 또한 이러한 환경 시퀀스를 포함하여 팬데믹에서 보고된 가장 초기의 바이러스 게놈에 대한 진화적 분석을 수행했으며, 인간을 감염시키고 COVID-19 팬데믹으로 이어진 바이러스의 가장 가능성 있는 전구체 유전자형을 추론했습니다. 그 결과는 시장 발병 이전에 감염된 인간이 거의 없거나 전혀 없었음을 의미합니다. 이는 시장 내에서 동물에서 인간으로의 스필오버와 일치합니다. 또한 바로 상류 동물 무역에서 영향이 제한적인 스필오버가 있었을 수도 있습니다.

"이 논문에서 우리는 시장과 관련된 시퀀스가 ​​시장 출현과 일치한다는 것을 보여줍니다."라고 Débarre는 말합니다. "SARS-CoV-2의 주요 다양성은 처음부터 시장에 있었습니다."

새로운 연구는 SARS-CoV-2의 가장 가능성 있는 중간 숙주가 될 수 있는, 습식 시장에서 동시에 발생하거나 바이러스 샘플에 가까이 있는 동물 종의 짧은 목록에 올랐습니다. SARS-CoV-2에 취약한 종이며 2003년에 SARS-CoV를 보균했던 일반 너구리는 시장 야생 동물 노점의 샘플에서 가장 유전적으로 풍부한 동물로 밝혀졌습니다. SARS-CoV의 이전 발병과도 관련이 있는 가면 야자 사향 고양이의 유전 물질도 SARS-CoV-2 RNA가 있는 노점에서 발견되었습니다. Hoary 대나무 쥐와 Malayan 고슴도치와 같은 다른 종도 SARS-CoV-2 양성 샘플에서 발견되었으며, 다른 종들도 다수 발견되었습니다.

이 데이터는 이들 동물 중 한 마리 이상이 감염되었는지 증명할 수 없지만, 연구팀의 분석은 바이러스를 가장 쉽게 옮길 수 있는 종의 목록과 이들의 유래를 추적하는 데 도움이 될 수 있는 유전 정보를 명확하게 보여줍니다.

조사관들은 특히 미국에서 소에게 조류 독감 바이러스가 퍼진 것과 같은 다른 최근의 스필오버를 감안할 때 COVID-19 팬데믹의 기원을 이해하는 것이 중요하다고 강조합니다. Worobey는 "SARS-CoV-2의 기원에 대한 많은 허위 정보와 잘못된 정보가 있었습니다."라고 말합니다. "이를 알아내는 것이 매우 중요한 이유는 이것이 미국뿐만 아니라 전 세계의 국가 안보와 공중 보건에 영향을 미치기 때문입니다. 사실, 팬데믹이 시작된 지 4년이 넘었지만 실험실 안전에 대한 관심이 높아졌지만 이와 같은 동물성 감염 시나리오가 다시 발생할 가능성을 줄이기 위한 조치는 많이 취해지지 않았습니다."

출처: https://www.sciencedaily.com/releases/2024/09/240919115136.htm